1°) Les fréquences alléliques sont estimées par dénombrement d'allèles. D'où, pour l'allèle A₁ par exemple :

fréquence deA1 =	2 x 32 + 36 + 60	= 0,20 = p
	2 x 400

fréquence de A₂ = 0,30 = q ; fréquence de A₃ = 0,50 = r

2°) Les proportions de la panmixie sont en fait celles données par la loi de Hardy-Weinberg.
a) Fréquences théoriques des génotypes d'après la loi de Hardy-Weinberg

A₁A₁ : p² = 0,20²
A₁A₂ : 2 pq = 2 x 0,20 x 0,30
A₂A₂ : q² = 0,30²
A₁A₃ : 2 pr = 2 x 0,20 x 0,50
A₃A₃ : r² = 0,50²
A₂A₃ : 2 qr = 2 x 0,30 x 0,50
avec p, q, r : les fréquences respectives des allèles A_1, A₂ et A₃

b) Effectifs théoriques

A₁A₁ : 0,20² x 400 = 16
A₁A₂ : 48
A₂A₂ : 36
A₁A₃ : 80
A₃A₃ :100
A₂A₃ :100

c) Comparaison des effectifs théoriques aux effectifs observés par un test chi deux de conformité

dd1 = 6-2-1 = 3 ; au seuil de 5%, le X² calculé est supérieur à celui de la table (7,815) il est donc hautement significatif. Par conséquence les proportions des génotypes ne sont pas conformes à celles de la loi de Hardy-Weinberg, on peut rejeter l'hypothèse de la panmixie.


3°) La consanguinité a pour effet d'augmenter la fréquence des homozygotes et de diminuer celle des hétérozygotes, par rapport aux proportions données par la loi de Hardy-Weinberg. C'est effectivement ce que l'on constate. Par conséquent, la consanguinité peut expliquer les écarts significatifs entre les effectifs observés et théoriques précédents.

Pour l'ensemble de la population, les fréquences théoriques des génotypes sont :

A₁A₁ : (1 - F) p² + Fp A₁A₂ : 2 pq (1 - F)
A₂A₂ : (1 - F) q² + Fq A₁A₃ : 2 pr (1 - F)
A₃A₃ : (1 - F) r² + Fr A₂A₃ : 2 qr (1 - F)

4°) La fréquence des A₁A₂ permet tout simplement de calculer F :
fréquence des A₁A₂ = 2 pq (1 - F)

36	= 2 x 0,20 x 0,30 (1 - F )
400

1 - F = 0,75 F = 0,25